Il primo insediamento di Abbadia San Salvatore fu l’antica abbazia benedettina, intorno alla quale si è poi sviluppato il paese, con il borgo medievale ancora cinto da mura. L’abbazia, dedicata a San Salvatore, fu fondata nel 750 da un nobile longobardo e nel XII secolo era molto potente e ricca. San Salvatore fu anche un importante centro di cultura; vi si conserva ancora una copia della cosiddetta Bibbia Amiatina, considerato il più antico e completo documento della Bibbia nella versione latina, affidata in custodia ai monaci da papa Gregorio II. In tempi moderni, importante per la storia della città fu il complesso della miniera per l’estrazione del cinabro e la produzione di mercurio, attiva ad Abbadia San Salvatore dal 1899 alla metà degli anni ’70 del Novecento.